Древнее святилище
"Томская писаница"
Памятник наскального искусства эпохи бронзы – раннего железного века
По праву считается достоянием и гордостью не только Сибири, но и всей России. Уже в древности Томская писаница являлась своеобразным природным святилищем, на скальные поверхности которого наносились рисунки, древнейшие из которых возрастом 4 тысячи лет.
На скальном массиве насчитывается около 300 изображений, выполненных в различной технике: выбитые, прочерченные тончайшими линиями, прошлифованные, нанесенные краской.

Комплекс "Шорский улус Кезек"
Реконструкция усадьбы зажиточного шорца c аутентичными хозяйственными постройками
Это комплекс подлинных жилых и хозяйственных построек шорцев конца XIX – начала XX веков. Гости "Томской Писаницы" могут посетить жилой дом зажиточного шорца "эм", летнюю кухню "сенек", увидеть амбары "анмарак", кузницу, баню "мыльча", скотный двор. Модель шорского кладбища и "Дом шамана" дают представление о религии шорцев.

Славянский мифологический лес
Духовная культура древних славян
Окружённая лесом и уединённая экспозиция подчёркивает почитание славянами сил природы. В центре установлен макет Збручского идола. Вымощенная камнем площадка окружена круглым рвом, на дне которого устроены костровища.
Это собирательный образ древнеславянского капища. За основу были взяты летописные и археологические данные, полученные при изучении не только восточных славян, живших в районе Новгорода, но также славян, проживавших на территории России, Украины, Беларуси, Польши и Германии в эпоху раннего средневековья (V-XI вв.).

Территория сказок
В зимний период "Резиденция кузбасского Деда Мороза"
Открыта в 2003 году. На "Сказке" находится резиденция Деда Мороза, а также проходят все новогодние и Рождественские праздники. В декабре 2005 года в Кузбасс из Великого Устюга приезжал с визитом Российский Дед Мороз. Он вручил верительную грамоту о том, что музей-заповедник "Томская Писаница" является представительством Российского Деда Мороза в Кемеровской области.

Зоопарк
Первый на территории Кемеровской области стационарный зоопарк
История создания музейного зоопарка началась с 1996 года, когда там появился первый обитатель – маленький шустрый медвежонок, который, к сожалению, остался без матери. Теперь это наш старожил Миша. За эти годы он превратился в могучего огромного зверя.
Туристов из года в год встречают постоянные обитатели зоопарка – волки, рыси, еноты, олени и другие животные. Среди питомцев "Томской Писаницы" есть и птицы – коршуны, неясыти, болотная сова и т.д. Взрослые и дети могут пообщаться с домашними животными в контактном зоопарке "Сельский дворик", где можно покормить козу, овцу, кроликов, кур, гусей и уток.